Kromě čistě domácího videa se začaly na YouTube brzy objevovat i sestřihy televizních pořadů, filmů či klipů, což vyvolávalo spory o autorská práva. A to zejména poté, co firmu koncem roku 2006 koupil internetový gigant Google (za 1,65 miliardy dolarů).
V roce 2008 například muselo být z YouTube staženo tisíce videí kvůli sporu s vydavatelstvím Warner Music a v roce 2009 byl například v Británii a Německu dočasně zablokován přístup k hudebním klipům kvůli sporům o výši plateb s ochrannými autorskými svazy.
Reforma ochrany autorských práv na internetu, kterou schválili loni v březnu poslanci Evropského parlamentu, nově ukládá právní odpovědnost za obsah internetovým platformám jako je YouTube.
Ty mají používat softwarové filtry, jež by porušování autorských práv zabránily. Automatické algoritmy tak zkontrolují nahrávaný obsah na internet a v případě zjištění jeho závadnosti jej hned smažou, což podle kritiků vede k cenzuře internetu.