Online hráči předčili vědce, našli strukturu bílkoviny

Jakub Novák
25. 9. 2011 13:14
Úspěch online hry Foldit ukazuje, jak mohou počítačoví hráči pomoci vědcům
"Nevyřešená" struktura enzymu opičího viru
"Nevyřešená" struktura enzymu opičího viru | Foto: University of Washington

Seattle - O tom, že věda skutečně může být hrou, svědčí nedávný úspěch hráčů online hry Foldit. Těm se totiž podařilo vyřešit strukturu bílkoviny, na níž si před nimi "vylámali zuby" vědci.

A jelikož se jedná o enzym nezbytný v životním cyklu retrovirů (mezi něž patří například dobře známý virus HIV), otevřeli tak zároveň dveře do "nové úrovně".

Díky hráčům teď vědci mohou navrhnout ideálně padnoucí molekulu, která by tento enzym specificky a účinně zablokovala.

Cesta k léku?

Tato bílkovina, pocházející z Mason-Pfizerova opičího viru, patří do skupiny zvané "retrovirální proteázy", což jsou enzymy kódované přímo virem a schopné štěpit některé další bílkoviny. Jejich výzkum je důležitý proto, že by mohl pomoci vyvinout účinný lék proti viru HIV, který způsobuje smrtelné selhání imunity AIDS.

Snahy najít vhodnou látku blokující tyto enzymy však obvykle selhávají na prosté neznalosti jejich struktury.

O tom, jak daná bílkovina vypadá, rozhodují velká množství vzájemných vazeb mezi jednotlivými součástmi. Jejich cílem je, aby výsledná stavba dosáhla co nejmenší energie, a tudíž největší stability. To pro vědce často představuje velký problém.

V tomto případě, po delším neúspěšném snažení, přistoupili výzkumníci k netradičnímu řešení - vytvoření hry, ve které měli hráči tento protein správně "složit". Možnost účastnit se touto formou výzkumu přilákala tisíce lidí po celém světě.

Firas Khatib, biochemik z University of Washington, k tomu řekl: "Chtěli jsme zjistit, zda lidská intuice může uspět tam, kde selhaly automatizované metody."

Člověk vs. stroj

"Lidé jsou schopní prostorového uvažování, to jest něčeho, v čem počítače stále příliš nevynikají," říká zase Seth Cooper, spoluautor studie a jeden z hlavních vývojářů hry nazvané Foldit (z angl. "fold it" - "sbal to").

A skutečně, hráčům se podařilo vytvořit model, který umožnil vědcům v průběhu několika dní určit výslednou strukturu enzymu. Navíc se ukázalo několik míst velmi vhodných pro zacílení látky, která by celý enzym zablokovala.

Jak vědci, tak hráči jsou proto uvedeni jako spoluautoři studie publikované v odborném časopise Nature Structural & Molecular Biology.

Z Česka na tomto projektu spolupracovala také Iva Pichová z Ústavu organické chemie a biochemie Akademie věd České republiky.

 

Právě se děje

před 1 hodinou

NHL, NBA a MBL zrušily kvůli nepokojům v Minnesotě dnešní zápasy zdejších týmů

Po nedělním úmrtí dalšího černošského mladíka po zásahu policie v Minneapolis byly odloženy zápasy místních týmů Minnesoty v profesionálních ligách NHL, NBA a MLB. Do dnešního programu nezasáhnou hokejisté Wild proti St. Louis, basketbalisté Timberwolves proti Brooklynu ani baseballisté Twins proti Bostonu Red Sox. Vedení soutěží zápasy odvolalo s ohledem na tragickou událost a kvůli nejisté bezpečnostní situaci vzhledem k nepokojům v oblasti.

V Minneapolisu, kterým loni na jaře otřásla smrt George Floyda, o víkendu zemřel po zásahu policie dvacetiletý Daunte Wright. Na severním předměstí Brooklyn Center jej v neděli postřelila policistka a později byl prohlášen za mrtvého. Šéf tamní policie následně uvedl, že se jednalo o nehodu, při níž si strážnice spletla paralyzér s pistolí.

Událost v oblasti vyvolala protesty a nepokoje a místní úřady se rozhodly v Minneapolisu a sousedním městě St. Paul vyhlásit na dnešní noc stav nouze a zákaz vycházení.

Zdroj: ČTK
před 1 hodinou

Sevilla si parádním obratem upevnila čtvrté místo ve španělské lize

Fotbalisté Sevilly zdolali ve španělské lize po obratu ve druhém poločase Celtu Vigo 4:3. Tým českého brankáře Tomáše Vaclíka, který byl opět jen na lavičce, bodoval v pátém zápase za sebou a upevnil si čtvrté místo v tabulce znamenající postup do Ligy mistrů.

Sevilla se dostala do vedení v sedmé minutě, pak ale dvěma brankami otočil skóre Iago Aspas, poprvé se trefil z penalty. Na Fernandovo vyrovnání odpověděl ještě do přestávky Brais Méndez a poslal domácí do vedení 3:2.

Hosté obrat nastartovali po hodině hry, kdy se podruhé v sezoně trefil Ivan Rakitič. Výhru pak dokonal Alejandro Gómez.

Španělská fotbalová liga - 30. kolo:

Vigo - FC Sevilla 3:4 (20. z pen. a 23. Aspas, 43. Méndez - 7. Koundé, 35. Fernando, 60. Rakitič, 76. Gómez).

Zdroj: ČTK
před 3 hodinami

Hokejisté CSKA Moskva jsou prvními finalisty KHL

Hokejisté CSKA Moskva jsou prvními finalisty Kontinentální ligy. Nejlepší tým základní části vyřadil Petrohrad po vítězství 4:2 na zápasy ve finále Západní konference. Postupový bod získal na ledě SKA po výhře 2:0.

Šestý zápas rozhodli ve prospěch posledních šampionů brankami ve druhé třetině Maximové Šalunov a Sorkin. Brankář Lars Johansson zlikvidoval všech 30 střel a vychytal potřetí v sérii čisté konto.

CSKA bude hrát o Gagarinův pohár potřetí za sebou. V sezoně 2017/18 prohrál finále s Kazaní, rok na to porazil Omsk. Vloni se play off kvůli pandemii koronaviru nedohrálo. Právě mezi oběma jeho předchozími finálovými soupeři se rozhodne o druhém účastníkovi závěrečných bojů. Po pěti zápasech vede Avangard s českým brankářem Šimonem Hrubcem nad Kazaní 3:2 a v úterý může na domácím ledě rozhodnout.

Další zprávy