"Zaměřujeme se také na osoby, o kterých si myslíme, že těmto osobám, tedy ruským agentům, poskytly minimálně součinnost," řekl novinářům pořadu Reportéři ČT dozorující státní zástupce Martin Malůš.
Investigativní reportér portálu Bellingcat Christo Grozev uvedl, že Šapošnikov několik dní před vrbětickým výbuchem cestoval do Portugalska a ve stejnou dobu tam pobýval i velitel elitní jednotky GRU 29155 Andrej Averjanov. Důstojníky této jednotky Anatolije Čepigu a Alexandra Miškina považuje český vyšetřovací tým za strůjce vrbětických explozí.
Šapošnikov veškerá podezření odmítl. "Co to znamená nějaký agent? Já žádné agenty neznám," řekl České televizi. Averjanova nezná, uvedl. Společnost Imex Group, která si sklady ve Vrběticích pronajímala, podle svého právního zástupce Radka Ondruše o žádných kontaktech Šapošnikova s GRU neví. "Šapošnikov řekl, že Averjanova nezná. Neviděl ho, nesetkal se s ním, žádné e-maily si nepíší," uvedl Ondruš.
Při výbuchu prvního ze skladů v říjnu 2014 zemřeli dva lidé, druhý explodoval v prosinci téhož roku. V době explozí areál ve Vrběticích spravoval státní podnik Vojenský technický ústav. Podezření, že do výbuchů byli zapojeni Čepiga a Miškin, které britští vyšetřovatelé podezřívají z otravy bývalého ruského tajného agenta Sergeje Skripala a jeho dcery Julije v britském Salisbury v roce 2018, vyvolalo diplomatickou roztržku mezi Českem s Ruskem.