Benátky žijí neustále v křehké rovnováze mezi odlivem a přílivem, které se obvykle pohybují v rozmezí 50 cm. Město postavené na několika ostrůvcích je ale vystaveno také pravidelným záplavám, při kterých slaná mořská voda ničí historické poklady města.
Takzvaná acqua alta (vysoká voda) pustoší Benátky nejvíc v posledních desetiletích. Jde o kombinaci klimatické změny (vyšší hladina moře) a klesání dna pod samotným městem. Při velkých záplavách je nejzranitelnější náměstí Svatého Marka, které je nejnižším bodem Benátek. Leží pouhý metr nad hladinou moře.