Zeman Lipavského odmítl jmenovat ze čtyř důvodů, jedním z nich bylo právě vzdělání. Lipavský má podle něj nízkou kvalifikaci, protože absolvoval jen bakalářské studium. Odkázal se na informace týdeníku Euro, podle kterého byla závěrečná bakalářská práce Lipavského hodnocena "nejhorší možnou známkou".
Kandidátovi na šéfa české diplomacie dále vyčetl "distancovaný postoj" ke spolupráci se zeměmi Visegrádu (Slovensko, Polsko, Maďarsko) a ke vztahu s Izraelem, což podle prezidenta je v rozporu s programovým prohlášením. Lipavský opakovaně odmítl tvrzení, že s těmito zeměmi nechce spolupracovat. Poslední výtku k Lipavskému má Zeman kvůli jeho návrhu, aby se příští Sudetoněmecké dny konaly na českém území (co tvrdí prezident a jaká jsou fakta, jsme shrnuli zde).
Zeman v předchozí vládě Andreje Babiše jmenoval do funkce ministra vnitra Jana Hamáčka, který má jen středoškolské vzdělání. Do čela resortu dopravy jmenoval v roce 2013 také bakaláře Zdeňka Žáka, který byl členem úřednického kabinetu Jiřího Rusnoka.
